В аниме "Подземелье Токио" мы встречаем Сэцуна — юного мастера боевых искусств, который, несмотря на свою репутацию отчаянного бойца, мечтает о романтических отношениях. В первый день старшей школы он случайно оказывается в драке, что отталкивает от него девушек. Вернувшись домой, Сэцуна находит двух очаровательных незнакомок, сбежавших из таинственного Подземелья, скрытого под Токио. Эти девушки, обладающие уникальными способностями, ищут убежище, но их преследуют опасные враги. Сэцуна оказывается втянутым в захватывающее приключение, где его навыки будут испытаны как никогда прежде.