Фильм "Элитный отряд: Враг внутри" погружает зрителя в мир Бразилии спустя 13 лет после операции по зачистке фавел. Полковник Насименту, возглавляющий спецподразделение BOPE, сталкивается с последствиями жестокости своих методов. После инцидента в тюрьме, где капитан Андре Матиас убивает заключённых, Насименту оказывается под давлением правозащитника Диоги Фраги и теряет свою должность. Переведенный в Секретариат Безопасности, он использует новые полномочия для борьбы с наркоторговлей, однако коррупция и криминальные сети лишь усиливаются, показывая, насколько сложно искоренить зло в системе.